При ошибке подписания документов ППО СУФД - для того, чтобы не возникало окно с предупреждение о блокировке, необходимо:
1. Почистить кэши java.
2.Добавить приложенный сертификат в хранилище.
2.1. Для пользователей IE необходимо добавить сертификат в системное хранилище доверенных сертификатов.
2.2. Для пользователей FireFox необходимо добавить сертификат в хранилище сертификатов java: 
-открыть панель управления;
-открыть консоль управления java;
-перейти на закладку "Security" в "Certificates"; 
-из выпадающего списка выбрать "Signer CA" и импортировать приложенный сертификат.